Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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NFKB1P19838 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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NFKB1P19838 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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NFKB1P19838 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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NFKB1P19838 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NFKB1P19838 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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