Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRFP10586 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms