Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SGF29Q96ES7 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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