Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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