Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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