Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SS18Q15532 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SS18Q15532 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SS18Q15532 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SS18Q15532 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SS18Q15532 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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