Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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