Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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