Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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