Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms