Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSSC4Q9Y5U2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms