Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNL1Q9UK58 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms