Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MLH3Q9UHC1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MLH3Q9UHC1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms