Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms