Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA3Q9NZ52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA3Q9NZ52 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms