Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCCC2Q9HCC0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms