Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms