Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms