Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubash3bQ8BGG7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms