Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM43BQ6ZT52 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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