Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR3Q6ZT12 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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