Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSAPQ6IQ19 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSAPQ6IQ19 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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