Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX8Q68G74 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX8Q68G74 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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