Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms