Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OC90Q02509 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OC90Q02509 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OC90Q02509 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OC90Q02509 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms