Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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