Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms