Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd1P48410 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms