Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd9P28357 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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