Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXP28300 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXP28300 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXP28300 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXP28300 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXP28300 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms