Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERBB3P21860 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERBB3P21860 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms