Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms