Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSPP15924 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSPP15924 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSPP15924 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSPP15924 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSPP15924 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms