Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms