Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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PKHD1P08F94 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PKHD1P08F94 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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