Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms