Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCBP2LA6PVI3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NCBP2LA6PVI3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms