Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms