Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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