Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
UBXN4Q92575 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms