Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RAB6CQ53S08 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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RAB6CQ53S08 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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RAB6CQ53S08 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB6CQ53S08 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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