Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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