Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SS18Q15532 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SS18Q15532 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms