Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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SEC23BQ15437 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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