Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms