| BRD3 | Q15059 | MAL2-207 | ENST00000522828 | 603 nt | TSL 3 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | MORF4L1P3-201 | ENST00000525966 | 950 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02553-201 | ENST00000529088 | 734 nt | TSL 5 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000873.2-204 | ENST00000530825 | 375 nt | TSL 3 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | YWHABP2-201 | ENST00000540201 | 713 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007569.1-202 | ENST00000547282 | 303 nt | TSL 3 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC084757.1-201 | ENST00000559987 | 490 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | NIFKP8-201 | ENST00000560500 | 874 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007639.1-201 | ENST00000577281 | 833 nt | TSL 3 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP001011.1-201 | ENST00000583546 | 690 nt | TSL 3 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | GMFG-202 | ENST00000594700 | 397 nt | TSL 2 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL353811.1-201 | ENST00000602851 | 736 nt | TSL 5 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC069431.2-201 | ENST00000604149 | 1099 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL121652.1-201 | ENST00000608851 | 448 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | IL21-202 | ENST00000611104 | 707 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC243756.2-201 | ENST00000618406 | 463 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | BX005214.3-202 | ENST00000619809 | 325 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR6839-201 | ENST00000620425 | 113 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC015871.5-202 | ENST00000623252 | 701 nt | BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL162425.1-201 | ENST00000423637 | 1525 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | OPRM1-215 | ENST00000520708 | 1519 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | CD164-207 | ENST00000504373 | 1402 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | XKR4-201 | ENST00000327381 | 19880 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH15-207 | ENST00000395430 | 7002 nt | TSL 5 BASIC | 5.72 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | EMB-205 | ENST00000514111 | 1475 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | DTNA-202 | ENST00000283365 | 6522 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.49 | | |
| BRD3 | Q15059 | BANK1-203 | ENST00000444316 | 3141 nt | TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | BAALC-AS1-201 | ENST00000499522 | 1353 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | EMSY-206 | ENST00000525038 | 4376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MATR3-228 | ENST00000620916 | 3134 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | NXT2-201 | ENST00000218004 | 2692 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RRP15-201 | ENST00000366932 | 7771 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AGBL4-201 | ENST00000334103 | 881 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | UBE2Q2P1-202 | ENST00000354771 | 883 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNASE11-202 | ENST00000398009 | 1034 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL009179.1-201 | ENST00000406085 | 265 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | VN1R51P-201 | ENST00000411675 | 945 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00342-201 | ENST00000412393 | 654 nt | TSL 3 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LIPT1P1-201 | ENST00000415870 | 1186 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DCN-203 | ENST00000420120 | 753 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS3P2-201 | ENST00000421346 | 701 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL009174.1-201 | ENST00000426577 | 416 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DPH5-204 | ENST00000427040 | 609 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | GNGT1-202 | ENST00000428834 | 731 nt | TSL 3 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590502.1-201 | ENST00000433019 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090018.1-201 | ENST00000434369 | 367 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DCN-205 | ENST00000441303 | 519 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MOB4-207 | ENST00000448447 | 1021 nt | TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02527-201 | ENST00000449069 | 762 nt | TSL 3 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068489.1-201 | ENST00000453706 | 261 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC244505.3-201 | ENST00000454598 | 187 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DCN-206 | ENST00000456569 | 228 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DUTP7-201 | ENST00000507982 | 486 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008885.2-201 | ENST00000509506 | 930 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01365-202 | ENST00000512219 | 637 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC138938.1-201 | ENST00000515431 | 782 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC104417.1-201 | ENST00000523974 | 751 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR8I1P-201 | ENST00000529291 | 931 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC087897.1-201 | ENST00000550134 | 156 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004551.1-201 | ENST00000552784 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068446.3-201 | ENST00000555285 | 382 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL390334.1-201 | ENST00000556395 | 450 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068722.1-202 | ENST00000559600 | 655 nt | TSL 3 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DCTN5-207 | ENST00000568272 | 523 nt | TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC139099.3-202 | ENST00000574856 | 439 nt | TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DPRXP4-201 | ENST00000578053 | 568 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC069304.3-201 | ENST00000603938 | 1084 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z82195.1-201 | ENST00000604558 | 398 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL353726.1-201 | ENST00000614041 | 1000 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC037198.3-201 | ENST00000616754 | 526 nt | BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | C8orf59-213 | ENST00000619594 | 859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | ARPP19-208 | ENST00000566423 | 5362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH15-215 | ENST00000409834 | 5401 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AGO3-203 | ENST00000373191 | 19687 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DDX58-201 | ENST00000379868 | 4089 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | ERVW-1-201 | ENST00000493463 | 2925 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | ST7-212 | ENST00000422922 | 1887 nt | TSL 5 BASIC | 5.71 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | BMPR2-201 | ENST00000374574 | 9683 nt | TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z95331.1-201 | ENST00000623075 | 23112 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | PCDH9-201 | ENST00000377861 | 28227 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | UGT2A1-203 | ENST00000503640 | 2595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | SRRM1-203 | ENST00000447431 | 3691 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | FMN1-202 | ENST00000334528 | 12355 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | ABCB5-202 | ENST00000404938 | 5811 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | CTAGE5-207 | ENST00000396165 | 3071 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB118-201 | ENST00000253381 | 1158 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-19P-201 | ENST00000363306 | 165 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU5E-10P-201 | ENST00000363506 | 118 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AGR3-202 | ENST00000402239 | 563 nt | TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LYST-AS1-201 | ENST00000412098 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC245060.4-201 | ENST00000413293 | 1121 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | IFNAR2-206 | ENST00000413881 | 710 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | FLJ27354-201 | ENST00000415584 | 788 nt | TSL 2 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL358176.3-201 | ENST00000420757 | 454 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL035660.1-201 | ENST00000422041 | 222 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND2P9-201 | ENST00000422293 | 931 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01589-201 | ENST00000422971 | 548 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007161.1-204 | ENST00000423039 | 460 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC012519.1-201 | ENST00000424588 | 610 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068631.1-204 | ENST00000428501 | 534 nt | TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |