Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms