Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ALCAMQ13740 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms