Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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