Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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