Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms